Les différents mythes fondateurs de la ville sont inextricablement liés aux croyances qui entourent son nom.

Le plus répandu attribue le nom de la ville, Aptera (qui signifie « sans ailes »), à une épithète de la déesse Artémis. Selon Pausanias, le nom est dérivé du héros mythique Pteras de Delphes, qui construisit le temple de laurier d’Apollon.

Étienne de Byzance, cependant, rapporte un mythe plus intrigant dans ses Ethniques. D’après lui, le nom est né du légendaire concours de chant entre les Muses et les Sirènes sur la colline. Les Sirènes vaincues devinrent blanches, arrachèrent leurs propres ailes et se jetèrent dans la mer. Leurs ailes blanches devinrent les îles Leukai (« blanches ») de la baie de Souda.